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    SSR/STR分子标记服务
    目录号:FZ-3 规格:询价

    微卫星其串联重复性的核心序列为1~6 bp,其中最常见的是二核苷酸重复,如:(CA)n ,每个微卫星的核心序列结构相同,重复单位数为10~60个,其高度多态性来源于串联重复单位数的不同。由于微卫星两端的序列一般是保守的,因此可以通过微卫星的侧翼序列设计引物,通过PCR扩增出长度不同的PCR片段,将PCR产物进行凝胶电泳,根据分离片段的大小决定基因型。





       

     技术路线

     


     

     

     

    SSR实验服务常见问题解答

    1)公司可以做哪几种荧光标记的检测?

        我们采用ABI3730X Genetic Analyzer  对扩增片段进行毛细管电泳检测,采用ROX500

    作为分子量分析内标(红色),PCR引物可以标记蓝色(FAM)、绿色(HEX)、

    黄色(NED),客户只需提供引物序列,我们负责荧光引物的合成,同时根据扩增

    片段的长度,设计引物组合、标记颜色组合,对多个位点复合扩增,同时检测,以

    便低成本高效的给客户完成实验。

     

    2)SSR相关收费标准?

        按照实验完整度,分以下几种:

    a.客户提供提供相关实验位点信息,我们完成整个实验,其中包括引物筛选及后续全

    部试验,收费为:20元/反应(不包括引物合成费),荧光引物的合成300元/对(包

    括上下游引物,荧光引物只标记其中一条)。b .客户按照标记要求,送来的荧光引

    物扩增后的PCR产物,收费为900元/板(96个样,包括内标价格)。c .对于多个位点同

    时检测,如:4个位点,混合上样,我们考虑到数据分析工作,每增加一个位点多100

    元,即:4个位点,在原有基础上增加了3个位点,共1200元。

     

    3)是否可以提供全部检测的峰图?

        我们可以提供部分检测峰图,如:每个位点检测到的等位基因对应的峰图,因为

    同一等位基因峰图基本一致,所以不一一提供。

     

    4)除了原始数据,一些常见遗传多样性分析参数是否可以提供?

        我们可以提供各位点检测到的等位基因,等位基因频率、多态信息含量(PIC)、期

    望杂合度、观察杂合度等常见的一些遗传学参数。

     

    5)对于一些未发表STR位点的物种,是否可以进行引物开发?

        对于未发表STR位点的物种,我们一般通过两种方法进行STR引物的开发。第一,

    从已发表的的近缘物种的SSR位点中筛选,多态性高,特异性好的SSR位点。但一般

    特异性不好。第二,我们通过磁珠富集法筛选开发SSR引物,该方法筛选的引物物种

    特异性较好,但实验周期会长一些。

     

    6)是否可以做SSR片段的回收克隆、测序?

         我们可以做STR的回收克隆测序,具体价格可协商。

     

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    参考资料

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    京公网安备 11011402011307号

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